Joikuarkistoprojektin tarkoituksena on varmistaa, että eri alueiden saamelaisten historiallisia ja nykyisiä musiikkiperinteitä sisältävät arkistoaineistot säilyvät tuleville sukupolville. Tällä hetkellä aineistot sijaitsevat hajallaan eri arkistoissa Suomessa, Ruotsissa, Norjassa ja Venäjällä. Aineistoja on myös muissa eurooppalaisissa äänitearkistoissa. Projektin päätavoitteena on luetteloida eri äänitearkistoissa olevat musiikkimateriaalit ja luoda näistä tiedoista kokonaistietokanta, joka helpottaa saamelaistenmusiikkiaineistojen käyttöä. Projekti osallistuu tarvittaessa myös aineistojen digitalisointiin. Tarkoituksena on tehdä myös pohjatyötä saamelaisen joikuarkiston perustamiseksi tulevaisuudessa.

Arkistoiduilla musiikkinaineistoilla on suuri merkitys saamelaisille, joiden perinteen säilyttämisen ja elvyttämisen kannalta historialliset ääniteaineistot ovat korvaamattomia. Aineistojen luettelointi on erittäin merkityksellistä myös saamelaismusiikkia koskevalle tutkimukselle. Projektia hallinnoi Suomessa Saamelaismuseo Siida (Inari), Ruotsissa Ájtte Ruotsin tunturi- ja saamelaismuseo (Jokkmokk) ja Norjassa Juoigiid Searvi (Joikaajien seura). Projektin toimii elokuusta 2005 vuoden 2007 loppuun. Projektia rahoittavat seuraavat tahot: EU Interreg ohjelma, Suomessa Lapin lääninhallitus, Ruotsissa Norrbottenin lääninhallitus, Ruotsin saamelaiskäräjät ja Statens kulturråd, Norjassa Norsk kulturråd ja Norjan saamelaiskäräjät. Projetin kokonaiskustannusarvio on 640.000 Euroa.